產品及特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供病毒樣品。
2. 根據瘧原蟲保守序列設計的專一性引物,與相關病毒無交叉反應。
3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應。
4. 一管式熒光定量 PCR 檢測,避免后續污染。
5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應體系的熒光定量 PCR。
規格及成分:
編號 |
成分 |
規格 |
試劑一 |
2×qPCR MagicMix |
500 μL(棕色管) |
試劑二 |
熒光 PCR 專用模板稀釋液 |
1 mL(黃蓋) |
試劑三 |
瘧原蟲染料法PCR 引物混合液 |
100 μL(白蓋) |
試劑四 |
瘧原蟲染料法PCR 陽性對 照(1×10E8 /μL) |
50 μL(紅蓋) |
試劑五 |
DNA 病毒裂解液(試用裝) |
15 次(9 mL) |
|
使用手冊 |
1 份 |
低溫運輸、-20℃保存,有效期一年。
自備試劑:
DNA 模板、10×ROX(根據機型決定,具體見使用方法)。
使用方法:
一、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6 個 10倍稀釋度為例):
1. 注意:由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對照。
2. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液(用帶芯槍頭,下同)。
4. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照,充分震蕩 1 分鐘,得1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中,充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備:
8. 如果有 N 個樣品,必須設置 N+2 個提取,多出的一個是 PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)。可以用 10μL 上步制備的 PCR 陽性對照的第 4號(濃度為 1×10E4 拷貝/μL,10μL 相當于 1 萬拷貝)或第 5 號(濃度為 1×10E5拷貝/μL,10μL 相當于 10 萬拷貝)再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為 PC。另外用水作為 NC。如果每次制備需要 200μL 樣品,則 PC 和 NC 的體積也必須是 200μL。
9. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數病毒 DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒 DNAout 或其升級版柱式病毒 DNAout。本試劑盒免費贈送 15 次一管式病毒 DNAout。
瘧原蟲染料法熒光定量PCR試劑盒
三、設置 qPCR 反應(20 μL 體系,在樣品制備室進行):
10. 如果只做 1 次重復,則標記 N+9 個 PCR 管,其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照,6 個用于 PCR 陽性對照。如果做 2-3 次重復,則反應設置數量相應增加 2 或 3 倍。
11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加):
成分 |
樣品管 N+2 個 |
PCR 陰性 對照管 |
PCR陽性對照管(2-7 管) |
2×qPCR MagicMix (棕色管) |
10μL |
10 μL |
各 10 μL |
瘧原蟲 PCR 引物混合液(白蓋) |
2 μL |
2 μL |
各2 μL |
自備 10×ROX (見注) |
2 μL |
2 μL |
各 2 μL |
N+2 待測樣品 DNA 模板 |
6 μL |
不加 |
不加 |
第 7 步所得 PCR 陽性對照稀釋液(2-7 號) |
不加 |
不加 |
各 6μL(2 號樣到 2 號管,3 號樣到 3 號管…) |
12.蓋上蓋子后上機,按下面參數進行PCR(具體PCR參數可以根據儀器不同而自行優化)。
過程 |
溫度 |
時間 |
預變性 |
92℃ |
5分鐘 |
PCR反應30個循環 |
94℃ |
60秒 |
50℃ |
60秒 |
|
72℃ |
60秒 |
具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產品中所含的熒光染料在不結合 DNA 時,吸收光譜在 471 nm,結合 DNA 時的吸收光譜在 500 nm,發射光譜在 530 nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。
四、數據處理:
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品 DNA 濃度的log 值,再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct 值如果大于或等于40則為陰性,如果小于40,則為陽性。